昼夜节律是否影响SARS-CoV-2 PCR检测的准确性?

文/坎迪斯·d·麦克诺顿,卡尔·赫希·约翰逊,迈克尔·j·沃德、乔纳森·e·施密茨和托马斯·a·拉斯科

准确发现导致COVID-19的病毒,是应对当前全球大流行危机的所有遏制和缓解战略的重要组成部分。聚合酶链反应(PCR)检测通常用于医院和诊所,因为它们具有高度的特异性,但假阴性检测也很常见,高达30%,尤其是在早期感染中。一些患者报告说,发烧和身体疼痛等症状在下午晚些时候更严重,这让我们问,病毒的脱落是否也可能在一天的时间有所不同;如果这是真的,这反过来也可能影响一天中不同时间的PCR检测的准确性,这将对检测策略以及用于阻止病毒传播的措施产生重要影响。

为了探索SARS-CoV-2病毒的脱落是否会随着一天中的时间而变化,我们检查了2020年3月至8月间从美国东南部一个医疗系统的6.8万名患者中收集的> 86000次SARS-CoV-2 PCR检测的结果。我们发现,阳性检测结果的比例在一天的不同时间有所不同,白天的阳性率高于夜间。对门诊、医院、急诊科等不同场所的阳性检测比例进行分析,发现门诊和医院采集的样本在不同时间呈下午高峰的变化规律;在急诊室的患者中,一天中不同时间的差异较小。

此外,中~ 2000测试的周期时间阈值,我们发现病毒遗传物质检测的数量大幅降低病人在晚上比白天(即水平在下午早些时候达到顶峰),即使调整了年龄、性别、种族、测试位置,月,和一周中的一天。

我们使用的数据来自常规临床护理期间收集的样本,因此不可能确切地确定哪些患者在样本收集时有症状,也不可能确定他们的临床病程已经走多远。这些数据也是在美国delta变种占据主导地位之前收集的。

然而,这些发现之所以至关重要,有两个原因。首先,对于确定一个人是否被感染的最敏感的判断,在中午进行检测似乎是最准确的。其次,我们的研究结果表明,SARS-CoV-2病毒的日常脱落有节律,这可能与人类免疫系统的昼夜节律调节有关。这表明,流感等病毒感染的情况,人们可能会更容易感染在一天的某些时候,他们可能更多的传染性在一天的某些时候,疫苗接种效果可能不同时间,对治疗的反应也可能随时间。鉴于发病率和死亡率的重大和持续的负担,这些问题中的每一个都有必要在今后的工作中加以重点。

文章的细节

SARS-CoV-2 PCR检测结果的日变化:检测准确性可能随时间而变化
Candace D. McNaughton,Carl Hirschie Johnson, Michael J. Ward, Jonathan E. Schmitz和Thomas A. Lasko
首次发布:2021年10月26日
DOI: 10.1177 / 07487304211051841
生物节律杂志

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